Комиссия была основана в 1966 году в Рио‑де‑Жанейро: на конференции полномочных представителей разных стран, включая СССР, приняли и подписали Конвенцию по сохранению атлантических тунцов — она вступила в силу в 1969 году. Главная задача ИККАТ — разрабатывать меры по защите запасов тунцов, а также сопутствующих видов, таких как мечерылые рыбы и акулы.
Россия (в то время — СССР) присоединилась к Комиссии в 1977 году. С тех пор специалисты ГНЦ РФ «Всероссийский НИИ рыбного хозяйства и океанографии» (ВНИРО) системно участвуют в ее работе: круглый год собирают промыслово‑биологические данные по тунцовым рыбам, входят в состав постоянного Научного комитета, принимают участие в ежегодных сессиях ИККАТ, а также готовят и представляют необходимую отчетность.
Важное направление сотрудничества — участие России в программе ИККАТ Electronic Bluefin tuna catch document (eBCD). Это информационная система прослеживаемости синего тунца: она позволяет отслеживать путь рыбы от рыбака до потребителя и служит одним из инструментов рационального регулирования промысла в Атлантическом океане.
Значимость работы российских специалистов подтверждает и внимание со стороны самой Комиссии: 30 июня 2026 года Секретариат ИККАТ направил поздравление в адрес Атлантического филиала ВНИРО.
Пресс-служба ВНИРО